ClfB Staphylococcus Aureus и спа-аллелей повторить регионы разделены на основные филогенетических линий
08 Ноя 2009
Надежное различие между золотистого стафилококка изолирует мы недавно разработали двухместный Locus Последовательность ввода (DLST) на основе анализа последовательности частичных clfB и спа-генов. Этот метод отличается высокой дискриминационным и дает однозначного определения типов. Высокой клональный структуры населения золотистого стафилококка предположить, что изолятов с идентичными или спа clfB аллелей принадлежат к той же клональный комплекс (УК), определяемой полилокусных Последовательность ввода (MLST). Чтобы проверить эту гипотезу, а также для расследования предполагаемого внутри ЦК генетической структуры, мы проанализировали в общей сложности 289 изолятов (186 и 103 MSSA MRSA) с DLST-, спа-и MLST стереотипов. Среди 289 штаммов, 242 были сгруппированы в основном MLST 7 СК, 40 несовершеннолетний в СЦ и 7 не были сгруппированы в СК. Были замечены в общей сложности 205 DLST-129 и SPA-типа. За одним исключением, все DLST-clfB, DLST-курортных и курортного типа аллели были выделены в СК. DLST типы обмена идентичными аллель (или clfB СПА) были сгруппированы помощью eBURST. За исключением одного штамма, все изолирует от каждой группы DLST принадлежал к тому же ГК. Однако, используя как DLST-и спа-вводить мы не можем раскрывать четко внутри ЦК структуры. Тем не менее, большое разнообразие этих локусов подтвердили, что они хорошие маркеры для местных эпидемиологических исследований.
Похожие записи
Метки: aureus, MRSA, MSSA, staphylococcus, анализ, золотистого, изолятов, стафилококк, стафилококка, штаммов
Рубрика: MRSA